台湾本周陷入了全球新冠疫情大流行爆发以来最严峻的防疫危机。
在七天内，台湾北部各县市每天都有发现本地确诊案例，且有多名感染者源头不明，专家称，新冠病毒估计已经进入社区。根据台湾「中央流行疫情指挥中心」统计，台湾今日（5月12日）新增了21名确诊病例，其中16例本土案例，刷新台湾纪录。指挥中心已于5月11日将全台湾的疫情警戒提升至第二级，台湾疫情最高警戒为第四级。
因应疫情逐渐加温，台湾总统蔡英文在脸书上表示，「防疫物资和医疗系统都是充足的，疫苗也会陆续到位，请大家放心。」
一度被视为全球防疫典範的台湾，正面临最严峻的考验，同时引发台湾是否在防疫意识上有所鬆懈，以及在疫苗採购上是否过于缓办的质疑。
台指挥中心目前已将疫情警戒提升至第二级，民众除了强制佩戴口罩之外，超过百人的室内活动以及五百人以上的室外集会，原则上取消。大众交通运输上禁止饮食。从目前已知的公开信息看，这波疫情危机始于四月底。中华航空（华航）的货机机师，在台湾桃园下榻的防疫旅馆「诺福特」酒店（Novotel）爆发群聚感染事件后，台湾新一波疫情便开始延烧。
据台湾媒体报道，华航货机机师疑似在台湾境外染疫后，回台后在机场附近的防疫酒店隔离检疫时，因为酒店疑似未严格遵守防疫措施，导致机组人员以及酒店员工交叉感染，随后传播给家人。
截至5月11日，与华航机组相关的案例已高达35例确诊，且有13例仍在调查中。同时间，本周台湾北部城市陆续出现无法追蹤来源的社区确诊案例，防疫警戒升级，台湾社会及舆论开始升高警戒。
住在台北市的王小姐（化名）告诉BBC中文说，自己因为在家工作，所以比较不担忧，但面对疫情仍然觉得要谨慎以对。「因为疫情太久了，大家有点麻痺，」她说。
多家台湾媒体指出，台湾因为疫情管控得宜较长时间，演唱会及各种经济及宗教聚会如常，造成民众在防疫上的鬆懈。
出现确诊病例的酒店及患者都被认为在防疫上警觉不够。譬如，许多病患在筛检前都因为出现新肺相关症状前去诊所就医数次，但许多医师及病患警觉心都不够，未建议病患立即筛检隔离，导致病人隔了许多天之后才去筛检。
不过，也有宜兰罗东医院的医师，在病人初诊时，便悉心询问，提高警觉，强烈建议病人检验，后来发现病人确实感染新冠。这种做法便成功阻断病毒继续传播。
这起危机，也再次凸显台湾辩论已久的疫苗问题。
目前台湾提供施打的疫苗，是英国的阿斯利康（AZ）疫苗。但由于台湾一直以来控管疫情得宜，民众施打意愿不高，加上过去传出这款疫苗造成若干人士出现血栓症状，因此自从3月22日台湾开放疫苗施打至今，疫苗接种率十分低，不到1％。
彭博社分析，以新加坡疫苗接种率将近19%与台湾比较，台湾要维持住防疫模範生的身份以及经济继续畅旺，施打疫苗是关键。确实，受到这波本土疫情刺激，台湾低迷的新冠疫苗接种数有了增加。5月6日全台接种人数达到6461人，打破纪录。根据台媒报导，接下去两周，台北医院施打疫苗几乎都已经额满。
王小姐也表示，因为自己要哺乳，无法跟先生一样今日便去自费施打疫苗。「不然为了小孩及社区安全，我会立即去施打疫苗。」
虽然台卫福部4月已经表示，已经购买到500多万剂的美国莫德纳 (Moderna)疫苗，台湾也希望自行研发的疫苗可以在七月上市，但目前台湾只提供阿斯利康疫苗。
台北市长柯文哲之妻，医师身份的陈佩琪，日前遭民进党质疑身为基层医师为何不施打阿斯利康疫苗时，便在脸书发文称，现在能施打的疫苗只有一种，并不适合所有人。
陈佩琪抨击民进党泛政治化处理疫苗议题，在疫情升温之际，絶非民众福祉。
事实上，台湾购买疫苗的种类及数量，一路走来并不顺遂，也被认为与台湾在国际医疗组织被边缘化，以及複杂的两岸关係有关。
今年2月17日，台卫福部部长陈时中，接受台媒访问时说，曾与德国BioNTech公司接触购买500万剂辉瑞疫苗，但在最后签约时生变。当时他被问到，BioNTech代理商上海复星医药公司，是否阻拦台湾採购疫苗，他回答称，「不敢这样说，但已经进行到最后一步，一般国际厂商来往很少到最后换约（换约指双方签名生效）时停下，情况不寻常。」
虽然当时BioNTech表示会提供给台湾疫苗，但此事最后不了了之，也引起若干民众及反对党批评。
台湾国民党智库「国政基金会」副董事长连胜文四月底批评民进党无法解决疫苗问题，防疫不力。
前总统马英九等人也抨击，台湾为何一开始就直接抗拒中国疫苗进入台湾，尤其中国已经多次表示愿意提供疫苗，协助台湾防疫。